但提名听证会举行前夕，一份美国司法部机密文件突然曝光，令布伦南成“众矢之的”。文件显示，如果当局认定某美国公民为“基地”组织分子，即使没有证据显示他正在参与瞄准美国的恐怖袭击，也可动用无人机将他击毙，这种“法外杀人”的做法令外界哗然。

听证会上，议员数次质询无人机问题，并怀疑奥巴马政府故意隐瞒涉及无人机空袭的关键文件。布伦南回应中情局及五角大楼使用无人机十分谨慎，“万不得已才会行使这些权利”。

白宫新闻发言人杰伊·卡尼5日也称，国会授权总统可以使用“一切必要手段”打击恐怖分子，因此动用无人机清剿恐怖分子“完全正确”，奥巴马此举没有越权，也不违宪。

7日早些时候，白宫对参众两院的情报委员会解密部分涉及无人机的文件，但仅允许本人查阅，不许下属翻看。分析人士指出，白宫此举意在为布伦南解围，希望参院尽快批准对他的提名，否则司法部密件一事继续发酵，布伦南很可能步候任防长哈格尔“后尘”，为争取参院批准经历一场苦战。