制度建设科学化的目标是构建科学的制度体系
内容协调。党的制度体系是各层次、各方面制度要素之间紧密连接、有机结合的完整系统。强调制度体系的内容协调，首先是各制度条文本身须目标明确、内容具体、结构合理、逻辑严密、形式规范、符合实际，既避免使人无所适从，又不能留下制度漏洞；其次是各制度要素围绕制度体系的目标，应保持设计思路的一致，搞好内容、范围与效力上的衔接，避免制度之间的矛盾和冲突；最后是党的规章制度与国家法律法规之间能够协调和衔接，坚持党在宪法和法律范围内活动的原则，使党的制度、党的活动符合国家法律法规的要求，同时善于把党的意志通过合法程序上升为国家法律法规。
程序严密。党的制度是按照一定程序科学制定的，也要按照既定程序严格执行，这样才能保障制度发挥应有作用。强调党的制度体系程序严密，首先是严格制度制定程序，对制定规划、调研起草、征询意见、修改完善、审定试行、反馈修订、正式实施等每一个环节都要有明确规定，把每一个环节的工作都做到位；其次是针对当前实体性制度较多、程序性制度较少问题，在高度重视实体性制度建设的同时加大程序性制度建设力度；最后是严格执行既定程序，特别是对制度执行中的程序变通现象进行制止和处罚，确保制度按程序执行到位。
配套完备。强调制度体系要配套完备，就是党的制度要纵向分级、横向分类，全面覆盖，不留死角。首先是党的制度设计要涵盖党的建设各个方面，覆盖党的建设每个环节，包含党员和党组织活动的各个领域，做到哪里有党员和党的组织哪里就有党的制度；其次是注重党的根本制度、基本制度与具体制度之间的配套衔接，注重党组织上下级制度规定之间的配套，克服宽严不当问题；最后是注重保障性制度机制建设，重点解决“靠什么做”的问题，促进制度的贯彻落实。
有效管用。强调制度体系的有效管用，就是指党的制度要能抓住主要矛盾，解决党的建设中存在的突出问题。首先是在深入把握规律的基础上加强制度建设，使党的制度符合时代发展要求和党的建设实际，着力增强制度本身的科学性；其次是紧紧抓住党的建设中的突出问题，以改革创新精神加强制度建设，着力增强制度的针对性和有效性；最后是加强宣传教育，严格责任追究，强化组织领导，切实提高制度执行力，确保制度行得通、管得住、用得好。
