两个研究小组2日分别公开了对欧洲近期肠出血性大肠杆菌流行病原的基因组测序初步分析结果，确认这种大肠杆菌聚合了至少两种大肠杆菌的致病特性。与此同时，德国的疫情仍未见缓解。德国医师协会会长说，德国卫生系统的应急能力正经受最大的考验。

中国深圳华大基因研究院和德国汉堡－埃彭多夫大学医学院2日宣布，中德科学家联合对本次流行的病菌进行了全基因组测序，初步分析结果显示，这种血清型O104大肠杆菌与2002年从中非艾滋病患者腹泻标本中分离的肠聚集性大肠杆菌55989菌株的同源性超过93％，同时它还通过基因水平转移获得了肠出血性大肠杆菌的毒力基因和毒力相关质粒，这可能与该菌株强毒性和重症感染有关。

同日，德国明斯特大学医学院卫生研究所也公布了由该所研究人员和美国生物技术公司“生命技术”联合进行的基因组测序结果。该所所长、细菌专家卡希认为，有关结果证实了他领导的研究团体一周前作出的判断，即造成本次疫情的菌株是O104：H4大肠杆菌的一个变种。他还说，这种“杂种克隆”聚合了肠聚集性大肠杆菌、肠出血性大肠杆菌和肠外致病性大肠杆菌的致病特性。

卡希强调，他的研究团体2001年从德国科隆两名感染者处采集的O104型大肠杆菌样本也同样具有这些混合特性。2001年的病菌样本和本次引发疫情的病菌具有同样的肠细胞附着性和受体结合特性。不同的是本次流行菌株对抗生素的抗药性有所扩展，此外它还表现出对肾细胞稍强一些的破坏能力。