城乡生活污染治理方面，全面完成“十一五”全省市、县建成一座以上生活污水处理厂的目标，但由于新建污水处理厂管网设施需进一步配套，三明、宁德两市生活污水处理厂负荷率尚不达标。福州、南平生活垃圾集中处理设施未按期建设完成。

工业园区和重点行业污水处理方面，闽江、九龙江流域按期完成60多家工业企业污染治理任务和17家企业清洁生产审核任务，但省级以上工业园区污水集中处理任务除南平市外，其余设区市均未按期完成。三明、南平个别企业未按期完成废水深度治理或整改任务。泉州德化，福州闽侯，龙岩武平、漳平，三明将乐等地的部分企业或园区，由于存在突出环境问题，被环保部通报或被列为2010年省级挂牌督办项目。

建筑饰面石材行业污染治理方面，敖江流域古田段石材行业整治初见成效，已建成污水集中处理设施；福州罗源、连江两县石材集中区均未建设污水集中处理设施，罗源县仍有部分石材加工企业未搬迁进入集中区。晋江流域的晋江、南安两市不合格石材企业关闭、取缔率较高，但同样存在石材集中区均未建成污水集中处理设施、未实现达标排放，仍有石材加工企业未搬迁进入集中区的问题。