费用短绌问题已浮现：海军战力最强的纪德级驱逐舰，就因耗油量大而成为“码头女王”；军官分发到纪德级，会立刻被恭喜，因为“出海时间短”。军方承认，为了节省油料，纪德级不常做海域侦巡，每次出海执行训练科目完毕就回港。

立院预算中心报告也指出，2008、2009年度，发生金融海啸，募兵达成率甚至超过120%，但2010年度景气恢复，达成率立刻跌到一半。预算中心还发现，灾害防救成为台军中心任务之一，但配套措施不合理，导致军方支援救灾所耗费的物力成本，往往还得自己埋单。

淡江大学战研所教授黄介正认为，面对目前问题，关键只有“实”一个字，军方高层必须对上说实话，而不只是“Yes，Sir！”或“誓死达成任务”，最后沦为表面文章。他指出，如果经费真的不足支应募兵，答案只有两个：一是冒着政策跳票压力延缓时程，二是增加预算，外加砍人省钱和卖地筹钱。