特侦组调查后发现，陈水扁不管在2008年8月14日坦承扁家海外资金的记者会，或法院开庭过程，都不断引用在任职时期特别搜集，与李登辉等人相关的笔录、文书；又在事后在处理自己及家族涉及贪渎、洗钱弊案时，提供扣案文书给检察官，并通过媒体公诸于世，借此移转舆论焦点。可见陈水扁侵占、隐匿扣案机密资料等文书，部分目的也在搜集相关政治人物的不利事证。

特侦组参照陈水扁在2008年8月14日的记者会指出，陈一方面承认短报选举剩余款，并汇往海外，同时也扯出李连马宋，要求特侦组一并侦办。

陈水扁当时指称，查兴票案时，宋楚瑜有3.8亿元(新台币，下同)汇到海外；查新瑞都案时，李登辉也利用人头汇出10亿元左右；连战在岛外投资置产，连战三代汇出海外的钱有多少？2008年马萧阵营一定短报献金，吁请特侦组一并侦办。

后来扁在法院开庭时提到，2008年选战末期，“调查局前局长”叶盛茂曾告诉他，有谢长廷通过亲友帐户汇款到海外的情资，甚至说“调查局”曾提供他报告、用Ａ四的纸张记载等。