此外，科管局和达裕公司在二○○四年签约，购地金额是八十六亿一千多万元；立法院在二○○七年审查预算时，删减科管局这项购地预算十亿元，科管局为此与达裕公司签订补充协议书，调降买卖总价款。

判决指出，纵使达裕公司在交易之初，确有将辜成允支付的四亿元佣金，计入缔约成本；后来因“立法院”不可预期的决议，已将四亿元佣金纳入成本的因素排除。

台北地院民事庭未推翻扁珍收受四亿元贿赂的刑事认定，但认为科管局与达裕公司签订土地买卖契约，不管是否因为达裕公司、辜成允诈骗，或是陈水扁、吴淑珍、李界木、蔡铭哲的胁迫，科管局都无法证明购地价格受到损失。