他指出，两岸之间要想真正推动和平发展，一定要建立互信。从过去4年的发展来看，今年8月8日到9日已经签署第17与第18项协议，这些其实就是很重要的政治性的协议；这些虽然没有成为和平协议，但发挥了维持两岸和平很重要的角色。

对于中国大陆的军事威胁，马英九表示，海峡两岸军事的平衡在2005年之后就已经转变；台湾在改善与中国大陆关系的过程中，会努力地促进和平繁荣，但也没有忽略建军与备战工作，因为“国防安全”仍然是台湾未来生存发展的基础。

他指出，与中国大陆的关系，第一线还是“两岸和解的制度化”，透过不断来往互动，降低彼此的敌意。这四年来有许多争议都可以透过协商解决，双方也开始建立信心。第二道防线是台湾需要在国际间扮演“和平缔造者”与“人道救援提供者”的角色，增加对国际社会的贡献。第三道防线才是“国防与外交结合” 。

马英九强调，在处理这些问题时非常谨慎，不会因为两岸关系改善而忽略“国防”；不过最重要的还是预防－预防任何的冲突发生。他最近主张“东海和平倡议”也是一样，不要等到发生了之后再来解决，这时伤害已经造成，双方应该透过各种和平的方式，来预防可能发生的冲突，不论是在东海还是两岸，都应该是同一个原则。