中国4艘海监船10月25日相继进入钓鱼岛海域12海里（约合22公里）内巡航，让日本又是一番紧张。日方出动巡逻船一路追踪中国海监船航向，日本首相官邸为此设立官邸对策室。日本外务省官员当天致电中国驻日本大使程永华，提出强烈抗议。日本内阁官房长官藤村修25日在记者会上称，对中国政府船“入侵日本领海”“非常遗憾”。中国外交部发言人25日表示，中国海监船在中国钓鱼岛领海进行例行维权巡航，是中国公务船对钓鱼岛海域行使管辖权的正常公务活动。

“中国海监船入侵日本领海，进入尖阁诸岛（即钓鱼岛）12海里海域”，这一消息25日上午登上日本各大门户网站的首页。日本《读卖新闻》称，这是自日本政府9月11日宣布将钓鱼岛“国有化”后，中国政府船第6次“入侵日本领海”。据日本海上保安厅公布的情报，25日上午6时半，3艘中国海监船从距离南小岛东南方向约12海里海域“进入日本领海”，约1个小时后，另一艘中国海监船从同一地点“进入日本领海”。日本巡视船对中国海监船发出警告“请立刻离开日本领海”，但中国方面回答，“这里是中国的领海”。报道称，日本巡逻船与中国船只并排行走，并保持高度警戒。

对此，日本首相官邸提高了对中国船只的应对级别，把设在危机管理中心的情报联络室升级为首相官邸的对策室。据共同社报道，25日上午，日本外务省事务次官河相周夫通过电话向中国驻日本大使程永华提出了强烈抗议，要求中国海监船尽快离开。程永华大使重申钓鱼岛是中国的领土，相关海域是中国领海和管辖海域，中国海监船系进行正常维权巡航公务活动，中方不接受日方交涉，要求日方立即停止对中国海监船公务活动的干扰。